梭式窯的燃燒系統是布置在兩側的窯牆上的
，燃燒的結構和布置方法視所選用燃料而異
。選擇燃氣或者選擇燒煤氣時
，可根據窯體的高矮來設置一層或多層燒嘴
。當火焰進入梭式窯內
，是從上而下加熱坯體的
。

燃料通過燒嘴的燃燒
，產生的高溫熱煙氣從窯車兩側與窯牆之間的縫隙流到窯車的頂部以後
，在煙囪抽力的作用下
，及窯車上的坯體之間的縫隙向下流動
。在此過程中
，熱煙氣把熱量傳給窯車上的坯體
，使其燒制爲產品
。

煙氣完成傳熱後的熱煙氣
，變爲廢氣
，最後從排煙系統的和煙囪排向大氣
。由於熱煙氣從上向下的流動符合流體力學中的分流垂直氣流法則
，既使氣流均勻分布
，所以梭式窯內的溫度比較均勻
，沒有像隧道窯內那樣的氣流分層現象
，這是梭式窯的一大優點
。